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平台功能说明、计价规则与常见问题。左侧目录可快速跳转,支持关键词搜索。

平台概览

提供从「文件提交 → 自动预检 → 价格评估 → 付款 → 计算/分析 → 结果下载/可视化」的一站式流程,覆盖分子对接、虚拟筛选、分子动力学模拟与在线作图分析。

建议使用完成结构检查的 PDB、PDBQT、MOL2 或 mmCIF 文件。提交后科研助理会进一步确认缺失残基、辅因子、金属离子、结晶水和质子化处理方案。

分子对接

上传受体(蛋白)与配体,实时预览结构,支持每日免费额度,超额从账户余额扣费。蛋白可用 PDB / CIF(后端自动转成对接格式);配体使用 PDB / SDF / MOL2,文件名勿含空格或中文;小分子文件需小于 10KB。

每天可免费提交 10 个对接任务,超出后 ¥1/次(不含作图)。通常 1 分钟内完成;大蛋白或多可旋转键配体耗时更长。

任务完成后可在「我的计算 · 任务列表」下载 result.zip:小分子-蛋白对接含处理后蛋白 PDB、Affinity 打分表(CSV)与 9 个 SDF 构象;蛋白-蛋白对接含处理后蛋白、HDOCK 打分表与 Top10 复合物模型。完成后也可开通在线作图分析,生成蛋白-配体相互作用图与明细表。

一般 1 分钟内完成,超过 8 分钟多为源文件异常,例如文件无法加载、格式报错、配体结构异常。请检查扩展名与编码,确保无中文、空格或特殊字符后重新提交。

分子模拟

选择体系、上传蛋白/配体、选择力场与时长、选择分析套餐并生成预估价格。常规体系按类型显示参考价,「其它体系」由科研助理核价。提交后由科研助理辅助校验结构与参数。

蛋白较大时,可以联系我们对蛋白进行适当切割,以降低价格。特殊体系(P450、超大配体等)价格会有差异。

分子模拟较为复杂,为避免出错,上传文件后请联系我们的SciCompute 科研助理(微信号:SCI415),对模拟体系进行评估与确认。

可先在提交页查看预估价格,或联系SciCompute 科研助理协助确认参数。套餐1 为基础轨迹与结合能分析,套餐2/3 在其基础上增加构象聚类、逐残基能量分解等分析。

任务列表

任务列表用于对接/模拟的状态查询与结果下载。任务列表仅展示当前登录账号提交的项目,约 60 秒自动刷新。

费用与发票

套餐1:100ns 基础价 ¥140(≤200AA),每超 100AA +¥20;200/500/1000ns 乘以时长系数;套餐2/3 在同等时长套餐1 上分别 +¥140 / +¥560。对接每日 10 次免费,超额 ¥1/次。

可在充值页在线充值,余额随任务消费实时扣减;对接超额从账户余额扣费。

推荐直接联系我们或在线提交开票信息。可开具「研发和技术服务-分子模拟与分子对接」「研发和技术服务-云计算服务」;试剂费等不可开具。请确保单位名称、税号与金额准确。也可联系SciCompute 科研助理(微信号:SCI415)更快核对并开票。

支持余额支付。一般需预付;金额较大可走公账,打款后亦可按流程退回预付款。需要合同、发票、对公转账请提前告知。